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加速AMBER计算
最新的 GPU 硬件配备 Quadro RTX、RTX 3090/3080/3070 等,可运行更快的 AMBER分子动力模拟。 -
预配置
使用示例作业提交脚本、基准测试、完全验证的测试套件和最新的软件补丁以快速实施。 -
开箱即用
联泰集群的工作站和服务器是完全交钥匙的,开箱即用,因此您可以避免配置和设置错误。
分子动力学AMBER优化的GPU系统
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分子动力学GPU工作站
入门级基本规格
CPU单颗英特尔至强W系列 CPUGPU多达 2 个英伟达 RTX 3070/3080/3090 GPU内存4个 16GB 内存硬盘1个512GB 固态硬盘 -
双路英特尔至强分子动力学工作站
中端级基本规格
CPU双路第三代英特尔至强可扩展(金牌)GPU多达 4 个英伟达 RTX 3070/3080/3090 GPU内存12个16GB 内存硬盘1 个 512GB 固态硬盘 (操作系统) 1 个 4TB 硬盘(数据) -
顶级分子动力学工作站
高端级基本规格
CPU2 个第三代英特尔至强可扩展(金牌)GPU多达 4 个英伟达 RTX 3070/3080/3090 GPU内存12个32GB 内存硬盘1 个 512GB 固态硬盘 (操作系统) 1 个 16TB 硬盘(数据)
AMBER 22 已应用于联泰集群系统
AMBER 22 软件包在 AmberTools 22 的基础上添加了 pmemd 程序,该程序类似于 AmberTools 中的 sander(分子动力学)代码,但在多个 CPU 上提供了(很多)更好的性能,并在 GPU 上提供了显着的速度改进。
主要新功能包括:
- l 使用软核势进行化学自由能计算
- l 类似 REST2 的增强采样(Replica Exchange Solute Tempering)
- l 使用高斯加速 MD (PPI-GaMD) 研究蛋白质与蛋白质的相互作用
- l 使用动量和力引导因子更新了自我导引的朗文动力学
- l Kernel Modified MD 允许动态更新力场