冷冻电镜图像重构与高性能图形工作站推荐

• 迭代重建算法：迭代地更新模型参数，直到达到收敛。

• 非迭代重建算法：直接计算模型参数，无需迭代。

• 后处理算法：用于对重建后的结构进行后处理，包括去噪、去模糊、去折叠等。

• CRYOSPARC 是一个用于单颗粒冷冻电镜数据处理和图像分析的软件平台。它提供从数据预处理、颗粒拾取、3D 重建到后处理等一整套功能，可以帮助研究人员快速高效地从冷冻电镜数据中获得生物大分子的 3D 结构   

• EMAN2（Electron Microscopy ANalysis 2）：由美国能源部阿贡国家实验室开发的软件，是冷冻电镜图像重建领域最早的软件之一。也是用于冷冻电镜图像处理的开源软件    

• IMOD（3D Image Modeling）：由美国斯坦福大学开发的软件，是冷冻电镜图像重建领域最广泛使用的软件之一。是用于冷冻电镜图像处理的开源软件                       

• RELION（REgularized LIkelihood OptimizatioN）：由瑞士苏黎世联邦理工学院开发的软件，是近年来快速发展的冷冻电镜图像重建软件。用于单粒子重建的开源软件

图像预处理：该环节主要使用图像处理算法，对冷冻电镜图像进行噪声滤波、图像对齐、图像配准等操作。该环节主要在 CPU 上进行计算
重建：该环节主要使用重建算法，从预处理后的图像中重建出生物大分子的三维结构。该环节主要在 CPU 或 GPU 上进行计算                      
后处理：该环节主要使用后处理算法，对重建后的结构进行去噪、去模糊、去折叠等操作。该环节主要在 CPU 上进行计算
内存：冷冻电镜图像通常很大，单张图像的大小可以达到 100MB 以上。因此，重建过程中需要大量的内存空间。
硬盘：冷冻电镜图像数据集通常很大，可以达到数百 GB 甚至 TB。因此，有足够的硬盘空间来存储数据也十分重要。

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